Egzamin państwowy nauczycielski złożył w 1937 r. W Rabce pracował do końca roku szkolnego 1938/1939. Następnie otrzymał angaż na stanowisko dyrektora Gimnazjum w Ropczycach. Działalność zawodowa W pierwszych dniach wojny udał się do Lwowa. Przeżył tu agresję wojsk radzieckich na Polskę 17 września. Do Kołaczyc powrócił w listopadzie 1939 roku i podjął pracę w tajnym nauczaniu, którego struktury organizacyjne były podporządkowane Inspektoratowi w Jaśle. Wszechstronna wiedza pozwalała mu na nauczanie różnych przedmiotów. W sierpniu 1940 r. zawarł związek małżeński z mgr prawa Janiną Matuszewską z Kołaczyc, gdzie zamieszkał. Po II wojnie światowej, w lutym 1945 r. powstało Państwowe Koedukacyjne Gimnazjum w Kołaczycach. Z dniem 12 kwietnia 1945 roku stało się ono filią zakładu jasielskiego. Janowi Baystakowi powierzono równocześnie stanowisko zastępcy dyrektora Państwowego Gimnazjum i Liceum w Jaśle. Gimnazjum w Kołaczycach, samodzielnym zakładem stało się dopiero 18 lipca 1945 r. Funkcję dyrektora pełnił Jan Baystak. W 1953 r. z własnej inicjatywy zrezygnował z kierowania szkołą i podjął pracę jako nauczyciel. Zmarł nagle 26 czerwca 1971 r. w czasie uroczystości zakończenia roku szkolnego.