Po 1957 roku na stacji w Witkowie urzędował zawiadowca stacji, dyżurny ruchu i kasjer. Posterunek dyżurnego ruchu zlikwidowano w 1971 roku, etat zawiadowcy ok. 1990 roku, a kasjera w 2000 rokuTorzewski 2006, s. 258. W 2003 roku pieczę nad stacją, jak i nad całą linią Gniezno – Anastazewo przejęło Biuro Utrzymania i Eksploatacji GKW. Do kwietnia 2009 roku budynek był niewykorzystywany. Od tej pory dawny budynek oraz kawałek bocznicy zajęła hurtownia materiałów budowlanych Rem-Bud.
Infrastruktura thumb|left|Stacja Witkowo (2013) Na stacji w Witkowie znajdowała się również parowozownia WKP. Był to budynek murowany, wyposażony w 3 stanowiska postojowo-naprawcze wraz z kanałami. Wjazd odbywał się poprzez obrotnicę o średnicy 6m. Na stacji Witkowie znajdowały się również skład opału, żuraw wodny. W kolejnych latach jej znaczenie malało, najbardziej z powodu wprowadzenia parowozów o zwiększonym zasięgu. Z powodu złego stanu technicznego rozebrano ją wiosną 1932 rokuTorzewski 2006, s. 61.
Ze stacji odgałęziały się bocznice do młyna parowego, tartaku, do majątku i gorzelni w Kołaczkowie. Bocznica do Kołaczkowa miała 2,5 km długości i była obsługiwana trakcją konną. Rozebrano ją ok. 1949 rokuTorzewski 2006, s. 63.