Szef Sztabu Generalnego WP Rozkazem nr 68 z dnia 23 marca 1999 roku wprowadził broń na wyposażenie Sił Zbrojnych RP..
Do 2006 roku Prexer dostarczył 17 656 pistoletów w wersji podstawowej WIST-94 i z laserowym wskaźnikiem celu WIST-94L, po czym w 2007 roku zawarto jeszcze umowę na dostawę 2554 sztuk (łączna liczba 20 210). W 2008 roku wojsko zaprzestało zakupów tej broni i zadeklarowało chęć zakupu nowego pistoletu, co doprowadziło do zakończenia jej produkcji. Podkreśla się, że jego producent Prexer nie specjalizował się wcześniej w produkcji broni palnej, produkował pistolet tylko dla odbiorcy wojskowego i nie inwestował w rozwój broni i stworzenie jej rodziny, mimo opracowania na początku XXI wieku odmiany WIST Compact.
Eksploatacja Wist był użytkowany w warunkach bojowych przez PKW Irak i PKW Afganistan. Służba w trudnych warunkach polowych przyniosła wiele uwag o awaryjności i mankamentach broni zgłaszanych przez jej użytkowników, co pociągnęło za sobą krytyczną ocenę konstrukcji i zaprzestanie dalszych zakupów. Zgłaszano częste zacięcia i uszkodzenia, skomplikowane rozkładanie, nadmierną siłę wymaganą do nacisku na spust, a także źle zaprojektowane kabury, powodujące wypadanie magazynków na skutek nacisku na przycisk zwalniania magazynka.