Basen portowy od Zatoki Puckiej oddzielają 2 falochrony po około 100 m. Szerokość toru wejściowego w główkach portu wynosi 70 m, a jego głębokość waha się od 4,5 do 5,0 m. Głębokość basenu portowego wynosi od 3,5 do 5,0 m. W porcie znajdują się betonowe nabrzeża: Obrońców Wybrzeża – długość 267 m; Kaszubskie – długość 135 m; Rybackie – długość 163,5 m. Pirs Kaszubski długości 50 m przeznaczony jest dla jednostek pasażerskich. W północno-wschodniej części basenu portowego znajdują się trzy pomosty, częściowo stałe (betonowo-drewniane na palach) i pływające o łącznej długości ok. 60 m każdy. Głębokości przy pomostach wynoszą 2,0 – 4,5 m. Pomosty przeznaczone są dla jednostek sportowych i turystycznych.
Port Jastarnia posiada bramownicę samojezdną (tzw. travelift) o udźwigu 75 ton oraz żurawia stacjonarnego o udźwigu do 6,3 ton.
Kutry miejscowych rybaków pływają z sygnaturą JAS na burcie.
Ruchem statków kieruje Bosmanat Portu Jastarnia podległy pod Kapitanat Portu Hel. Infrastrukturą portową administruje Urząd Morski w Gdyni.