Zmarł w szpitalu w dwa dni po skrytobójczym zamachu dokonanym przez dwóch nieznanych sprawców w jego domu we wsi Choroszczynka. Andrzej Bożyk twierdzi, że zamachu dokonała AK wykonując wyrok za zabicie przez podziemie ukraińskie dwóch PolakówKonflikt polsko-ukraiński na południowo-wschodniej Lubelszczyźnie podczas okupacji niemieckiej, w: „Biuletyn Ukrainoznawczy” nr 13, Przemyśl 2007, s. 168. Jacek Wysocki podaje ogólnie, iż Pasternak został zamordowany przez polskie podziemieJ. Wysocki, Ukraińcy na Lubelszczyźnie w latach 1944-1989, Instytut Pamięci Narodowej, Lublin 2011, , s.18. Według Ryszarda Torzeckiego nie zginął z wyroku sądu Armii Krajowej ani Delegatury Rządu„Iwan Pasternak nie zginął z wyroku sądu AK czy delegatury. Jeśli zrobili to Polacy, to był to skrytobójczy mord w wyniku miejscowych samosądów”. Cyt za: Ryszard Torzecki, Polacy i Ukraińcy. Sprawa ukraińska w czasie II wojny światowej na terenie II Rzeczypospolitej, Warszawa 1993 Wyd. PWN, s.290. Szerzej s. 270, 289–290.. Według Jana Kukawskiego do senatora I. Pasternaka w maju 1943 r.