U amadyńców występują trzy odmiany barwne: czarnogłowa, czerwonogłowa i złotogłowa. Najczęściej występującą jest czarnogłowa, w której występuje około 70–75% populacji (w jednym ze źródeł z lat 40. XX wieku, opartym na dowodach anegdotycznych, podano też wartość 82%). Forma złotogłowa jest najrzadsza, zależnie od źródła to jeden na kilka tysięcy osobników lub mniej niż 0,1% populacji. Proporcje w częstotliwości występowania formy czarnogłowej i czerwonogłowej są inne u samców i samic. Loci odpowiedzialne za opartą na melaninie czerń lub opartą na karotenoidach czerwień znajdują się na chromosomie Z. Gen kodujący czerwoną barwę jest dominujący względem tego kodującego czarną barwę na głowie. Stąd samce czarnogłowe są zawsze homozygotami recesywnymi (ZrZr), lecz czerwonogłowe mogą być homozygotą dominującą (ZRZR) lub heterozygotą (ZRZr). Samice są płcią heterogametyczną, więc możliwe układy to Zr (czerwonogłowe) i ZR (czarnogłowe). Amadyńce odmiany złotogłowej mają ten sam allel na locus odpowiedzialnym za barwę czerwoną. Złoty kolor powstaje wskutek epistazy – gen warunkujący złote ubarwienie głowy znajduje się na jednym z chromosomów autosomalnych.