W latach 1980–1981 Mubari pełnił funkcję doradcy technicznego w ministerstwie rybołówstwa i gospodarki morskiej. W latach 1986–2002 zajmował stanowisko burmistrza gminy Wali na południu kraju. W tym czasie pracował również w ministerstwie rybołówstwa i gospodarki morskiej. W latach 2002–2003 był dyrektorem generalnym autonomicznego portu w Nawazibu. Od 13 listopada 2003 do zamachu stanu w sierpniu 2005 roku zajmował stanowisko ministra rybołówstwa i gospodarki morskiej w czasie rządów prezydenta Taji, Summit Communications...
W wyborach w styczniu i lutym 2007 roku dostał się do Senatu jako reprezentant regionu Maghama. 26 kwietnia 2007 został wybrany przewodniczącym Senatu. W głosowaniu uzyskał poparcie 41 senatorów wobec 11 głosów przeciwnych jego kandydaturze„Le Sénat élit M. Bâ Mamadou dit M’Baré, son président”, AMI, 26 kwietnia 2007..
Prezydentura 15 kwietnia 2009 Ba Mamadu Mubari przejął pełnienie obowiązków prezydenta Mauretanii po tym, jak przewodniczący Rady Państwa Muhammad uld Abd al-Aziz zrezygnował z urzędu, by wziąć udział w wyborach prezydenckich w czerwcu 2009 roku.