Klemen Bauer (ur. 9 stycznia 1986 w Lublanie) – słoweński biathlonista, srebrny medalista mistrzostw świata.
Kariera Pierwsze sukcesy osiągnął w 2004 roku, zdobywając trzy medale na mistrzostwach świata juniorów w Haute Maurienne. W sprincie był drugi, a w biegu indywidualnym i sztafecie zajął trzecie miejsce. Na rozgrywanych rok później mistrzostwach świata juniorów w Kontiolahti ponownie wywalczył srebro w sprincie. Ponadto zajął trzecie miejsce w biegu indywidualnym podczas mistrzostw świata juniorów w Martell w 2007 roku.
Starty w Pucharze Świata rozpoczął zawodami w Oberhofie, zajmując 4 stycznia 2006 roku 13. miejsce w sztafecie. Pierwsze punkty wywalczył 16 grudnia 2008 roku w Hochfilzen, gdzie zajął 28. miejsce w sprincie. Nigdy nie stanął na podium indywidualnych zawodów tego cyklu, najwyższą lokatę wywalczył 14 lutego 2010 roku w Vancouver, gdzie był czwarty w sprincie. Walkę o podium przegrał tam z Jakovem Fakiem. Najlepsze wyniki osiągnął w sezonie 2009/2010, kiedy zajął 20. miejsce w klasyfikacji generalnej.