W latach 1990–1996 stał na czele Rady Kultury w austriackiej ambasadzie w Pradze, a od 1993 do 1996 był również dyrektorem Austriackiego Instytutu Kultury w Pradze. W latach 1996–1999 zajmował stanowisko ambasadora Austrii w Bośni i Hercegowinie. W latach 1999–2005 pracował w MSZ jako dyrektor Departamentu ds. Europy Środkowej, Południowej i Południowo-Wschodniej, Azji Środkowej i Kaukazu Południowego. Od 20 stycznia 2005 do 2009 zajmował stanowisko ambasadora Austrii w Słowenii.
23 lutego 2009 ministrowie spraw zagranicznych UE w czasie szczytu Rady UE zaakceptowali nominację Valentina Inzko na stanowisko wysokiego przedstawiciela dla Bośni i Hercegowiny„Nowy przedstawiciel wspólnoty międzynarodowej w Bośni”, psz.pl, 24 lutego 2009.„Austrian diplomat to succeed Lajcak in BiH”, Southeast European Times, 24 lutego 2009.. 13 marca 2009 jego kandydaturę zatwierdziła Rada ds. Implementacji Pokoju w Bośni (PIC). 26 marca 2009 objął oficjalnie stanowisko wysokiego przedstawiciela NZ dla Bośni i Hercegowiny oraz specjalnego przedstawiciela UE w Bośni i Hercegowinie„Inzko takes over as High Representative to Bosnia-Herzegovina”, People’s Daily Online, 27 marca 2009..