W 1984 roku zakład świętuje 25-lecie swojego istnienia oraz otrzymuje 10 autobusów Autosan H9 oraz 10 Jelczów Berliet PR110.lewo|mały|Autosan H9–35 na terenie zajezdni MZK.
III Rzeczpospolita W 1990 r. przedsiębiorstwo zostało przekształcone w Miejskie Przedsiębiorstwo Komunikacyjne w Chojnicach. Wówczas posiadało ono 38 autobusów, zatrudniało 165 osób i przewoziło 7742 tysiące pasażerów na 116 km sieci transportowej.
W 1991 roku MPK przekształcono w Miejski Zakład Komunikacji. Natomiast 2 marca 1993 roku przedsiębiorstwo przyjmuje aktualną formę prawną, czyli zostaje spółką z ograniczoną odpowiedzialnością: Miejski Zakład Komunikacji w Chojnicach sp. z .o. o.
Do 2001 roku nastąpiło przeniesienie siedziby firmy na ulicę Angowicką 53. Spółka w tym czasie zatrudnia 83 pracowników i posiada 30 szt. autobusów. mały|prawo|Plac parkingowy dla autobusów na terenie zajezdni
W 2010 r. linia nr 10 została przedłużona do miejscowości Ogorzeliny. MZK rozpoczęło też w tym roku obsługę linii podmiejskich. Pierwszymi liniami były linie K (Chojnice Dworzec – Konarzyny) i D (Chojnice Szpital – Dąbrówka). Następne, w 2011 roku zostały otwarte linie: R (Chojnice Drzymały – Rytel), O (Chojnice Cmentarz – Obkas), Z (Chojnice Dworzec – Zamarte) oraz P (Chojnice Lasek Miejski – Piastoszyn).