W 1995 roku otrzymał nominację na stanowisko profesora nadzwyczajnego, a w 1999 roku profesora zwyczajnego.
Bogdan Rok przebywał na stażach naukowych w kraju, w tym m.in.: Polskiej Akademii Nauk, Uniwersytecie Jagiellońskim i Uniwersytecie Warszawskim oraz za granicą (Marburg, Clermont-Ferrand, Wilno i Mińsk). Zorganizował 4 sympozja naukowe, m.in. XVII Krajowy Zjazd Polskiego Towarzystwa Historii Medycyny i Farmacji w 1994 roku. W wyniku kontaktów naukowych przygotował podpisanie umowy naukowej pomiędzy Uniwersytetem Wrocławskim a Uniwersytetem w Mińsku na BiałorusiPrzegląd Uniwersytecki, op. cit., s. 10..
Profesor Rok jest członkiem Wrocławskiego Towarzystwa Naukowego i od 1993 roku przez dwie kadencje pełnił w nim funkcję sekretarza II Wydziału. Należy także do Polskiego Towarzystwa Historycznego. W oddziale wrocławskim zorganizował i prowadził sekcję Historii Kultury i Nauki. Uczestniczy w pracach Polskiego Towarzystwa Historii Medycyny i Farmacji. W 1994 roku wybrano go po raz pierwszy do Zarządu Głównego tego towarzystwa, a trzy lata później po raz drugi. Został ponadto członkiem towarzystwa we Frankfurcie nad Odrą pod nazwą Projekt Deutsch-Polnische Geschichte. Należy do Białoruskiego Towarzystwa Historii Medycyny.