Pisma Manuel II był autorem wielu traktatów teologicznych, wierszy, listów, dzieł z dziedziny retoryki. Był świetnym stylistykiem i dialektykiem swoich czasów, interesował się religiami innych narodów. W czasie jednej z podróży dyplomatycznych na Zachód otrzymał we Francji traktat dotyczący dogmatu rzymskiego, na który odpowiedział po powrocie w 157 Rozdziałach (Kephálaja). Sławny do dziś jest również jego Dialog o religii chrześcijańskiej (Diálogos perí tes Christianem threskejas), zawierający 26 rozmów z Turkiem Muterizisem, apologią przeciw islamowi oraz głębokim i serdecznym wyznaniem ortodoksyjnej wiary. Dialog powstał w czasie pobytu cesarza na dworze tureckim w Prusie w 1390 roku. Jest cenny również ze względu na wiadomości obyczajowe i etnograficzne.
Życie prywatne Ożenił się z Heleną Dragaš. Dziećmi Manuela i Heleny byli między innymi: Jan VIII Paleolog – cesarz Bizancjum w latach 1425 - 1448, Konstantyn XI Dragazes – cesarz Bizancjum w latach 1448 - 1453, Teodor II Paleolog – despota Morei Demetriusz II Paleolog – despota Mistry i Morei Tomasz Paleolog – despota Mistry i Morei Andronik (1400 † 1428) – despota Tesalonik