Po czeskiej stronie żyło wielu Niemców, obywateli Austro-Węgier, którzy nagle znaleźli się w obcym im państwie. Początkowo planowali oni przyłączenie do Austrii, lecz ze względu na oddalenie od reszty tego państwa i wrogi stosunek władz w Pradze pomysł okazał się niewykonalny. W późnych latach 30. XX wieku Adolf Hitler wysunął pod adresem Czechosłowacji roszczenia przekazania Kraju Sudetów, zamieszkanego przez niemiecką mniejszość pod władzę III Rzeszy. W układzie monachijskim tereny te przeszły pod władzę niemiecką w 1938 roku. W 1939 Niemcy dokonali rozbioru Czechosłowacji tworząc z ziem czeskich Protektorat Czech i Moraw. Granica czechosłowacko-niemiecka przestała istnieć.
thumb|left|Kamień graniczny (widoczne są jeszcze symbole ČS – Československo i tablica Wolnego Państwa Bawarii) na szczycie Třístoličník/Dreisesselberg
Odtworzono ją po II wojnie światowej, jednakże była ona krótsza od przedwojennej, w związku z przekazaniem Polsce władzy nad niemieckim terenami na wschód od Odry i Nysy Łużyckiej. Tereny zagarniętego przez Hitlera Kraju Sudetów