Otto Ernst von Büngner (ur. 22 marca 1858 w Rydze, zm. 20 sierpnia 1905 w St. Blasien) – niemiecki lekarz chirurg, profesor Uniwersytetu w Marburgu.
Syn Roberta von Büngnera i Anny z domu ZwengerBuengner, Otto v. W: Baltisches Biographisches Lexikon. Studiował na Uniwersytecie w Dorpacie i na Uniwersytecie w Halle od 1877 do 1883; jego nauczycielami byli m.in. Eduard Georg von Wahl i Richard von Volkmann. W latach 1883-1885 był asystentem von Wahla w klinice chirurgicznej w Dorpacie, gdzie w 1885 uzyskał doktorat. W 1886 w Marburgu zdał egzaminy państwowe. Od 1887 do 1889 asystent w klinice w Halle. 25 października 1890 w Marburgu habilitował się. W 1894 roku został profesorem nadzwyczajnymPagel JL. Biographisches Lexikon hervorragender Ärzte des neunzehnten Jahrhunderts. Berlin-Wien 1901, ss. 275-276 www.zeno.orgOtto Ernst von Büngner na stronie Katalog Profesorów Marburg.
Na jego cześć nazwano tzw. pasma Büngnera.