W 1990 wszedł w skład Przejściowego Komitetu na rzecz Odnowy Narodowej (CTRN), tymczasowego rządu składającego się z urzędników cywilnych i wojskowych, powołanego przez prezydenta Conté. Był w nim odpowiedzialny za planowanie gospodarcze oraz współpracęConseil Transitoire de Redressement National.. W latach 90. XX w. kontynuował pracę w Ministerstwie Planowania i Ministerstwie Finansów, będąc przedstawicielem kraju w stosunkach z Afrykańskim Bankiem Rozwoju. W latach 1995–2008 Kabiné Komara zajmował stanowisko dyrektora ds. projektów i spraw administracyjnych w Afrykańskim Banku Eksport-Import z siedzibą w Kairze w Egipcie, który od 1994 zajmuje się promocją handlu między państwami afrykańskimi.

Kandydatura Komary na stanowisko szefa rządu pojawiła po raz pierwszy się już w lutym 2007 w czasie strajków i demonstracji związków zawodowych przeciw polityce i władzy prezydenta Lansany Conté. Strajki te zakończyły się kompromisem władz z protestującymi, polegającym na wyborze nowego premiera przez prezydenta Conté spośród listy osób zaproponowanych przez związkowców.