W kwietniu wzięła udział w podwodnej misji NEEMO 9 (NASA Extreme Environment Mission Operations) realizowanej przez NASA i Amerykańską Narodową Służbę Oceaniczną i Meteorologiczną (National Oceanic i Atmospheric Administration – NOAA) na pokładzie podwodnego laboratorium Aquarius. Przez 18 dni pracowała m.in. razem z astronautami: Ronaldem Garanem (NASA) i Dafyddem Williamsem (Kanada). 2007 – w lutym wyznaczono ją do załogi rezerwowej 17 ekspedycji na Międzynarodową Stację KosmicznąKomunikat NASA z 12.02.2007 o planowanych składach załóg ISS.. 2008 – w lutym oficjalnie potwierdzono włączenie jej do składu załogi STS-128Komunikat NASA o składzie załogi STS 128.. 2009 – 29 sierpnia na pokładzie promu kosmicznego Discovery wyruszyła w kierunku Międzynarodowej Stacji Kosmicznej. Pozostała na ISS w składzie 20 ekspedycji oraz 21 ekspedycji. Na Ziemię powróciła w listopadzie razem z załogą wyprawy STS-129. Stott została przydzielona do misji STS-133 na MSK – ostatniego planowanego lotu promu kosmicznego Discovery. Po swoim ostatnim locie przez rok była przedstawicielką Biura Astronautycznego przy programie komercyjnych lotów załogowych NASA w Kennedy Space Center, po czym wróciła do pracy w Centrum Lotów Kosmicznych imienia Lyndona B.