Struktura uczelni thumb|„Nowy budynek” Uniwersytetu Pedagogicznego thumb|Budynek Wydziału Pedagogicznego Uniwersytetu Pedagogicznego przy ul. Ingardena 4 w Krakowie thumb|Zespół budynków Wydziału Sztuki Uniwersytetu Pedagogicznego przy ul. Mazowieckiej 43 w KrakowieUczelnię tworzy pięć wydziałów oraz dziewiętnaście instytutów.
Wydziały Lista: Wydział Nauk Humanistycznych Wydział Nauk Ścisłych i Przyrodniczych Wydział Nauk Społecznych Wydział Pedagogiki i Psychologii Wydział Sztuki
Instytuty Lista: Instytut Bezpieczeństwa i Informatyki Instytut Biologii i Nauk o Ziemi Instytut Dziennikarstwa i Stosunków Międzynarodowych Instytut Filologii Angielskiej Instytut Filologii Polskiej Instytut Historii i Archiwistyki Instytut Malarstwa i Edukacji Artystycznej Instytut Matematyki Instytut Nauk Medycznych w organizacji Instytut Nauk o Informacji Instytut Nauk o Zdrowiu Instytut Nauk Technicznych Instytut Neofilologii Instytut Pedagogiki Instytut Pedagogiki Specjalnej Instytut Prawa, Ekonomii i Administracji Instytut Psychologii Instytut Socjologii Instytut Sztuki i Designu Instytut Zarządzania i Spraw Społecznych