Razem z francuskim embriologiem Étienne'em Serresem uhonorowany jest w nazwie prawa Meckla-Serresa.
Ponadto, dwie struktury anatomiczne noszą do dziś jego nazwisko: uchyłek Meckela chrząstka Meckela.
Opisał też zespół wad wrodzonych, znany dziś jako zespół Meckela lub zespół Meckela-Grubera.
Wybrane prace De cordis conditionibus abnormibus. Halle, 1802 Abhandl. aus der menschlichen und cvergleichenden Anatomie und Physiologie. Halle, 1806 Beyträge zur vergleichenden Anatomie. 2 tomy. Leipzig, C. H. Reclam, 1808-1811 Versuch über den Bau des kleinen Gehirns in Menschen und Thieren. Deutsches Archiv für die Physiologie (1808) Handbuch der pathologischen Anatomie. 3 tomy. Leipzig, Carl Heinirich Reclam Diss. de ascidiarium structura. Halle, 1814. De duplicitate monstrosa commentarius. Halle-Berlin, 1815. Handbuch der menschlichen Anatomie. 4 tomy. Halle-Berlin, 1815-1820. Ueber den regelwidrigen Verlauf der Armpulsadern. Deutsches Archiv für die Physiologie 2, ss. 117-131 (1816) Tabulae anatomico-pathologicae modos omnes quibus partium corporis humani omnium forma externa atque interna a norma recedit exhibentes. 4 części. Leipzig, I. F. Gleditsch, 1817-1826 System der vergleichenden Anatomie. Halle, Renger, 1821-1831 Anatomisch-physiologische Beobachtungen und Untersuchungen.