Okres III RP W roku 1994 dobudowano wieżę kościelną. W miejscowości Podgórze w latach 1989 - 2000 staraniem ks. prob. Henryka Gołaszewskiego i ks. prob. Mariana Mieczkowskiego został zbudowany kościół filialny pw. św. Antoniego Padewskiego, który aktualnie należy do parafii św. Andrzeja Boboli, który służy tam jako kościół rektoralny.

W kościele katedralnym znajduje się czczony przez wiernych cudowny obraz Matki Boskiej Łomżyńskiej – Matki Pięknej Miłości, koronowany w Łomży 4 czerwca 1991 r. przez Ojca Świętego Jana Pawła II podczas IV pielgrzymki do Polski. W roku 2000 przeprowadzono gruntowny remont kaplicy, w której znajduje się obraz Matki Boskiej Łomżyńskiej.

Kościół parafialny

Regentka Księżna mazowiecka Anna i jej synowie Janusz III i Stanisław byli kolatorami kościoła pw. św. Michała Archanioła i św. Jana Chrzciciela, który został zbudowany w latach 1504 - 1525. W roku 1526 odbyło się uroczyste przeniesienie do nowego kościoła chrzcielnicy, a także przeniesiono uprawnienia parafialne z kościoła Rozesłania Apostołów. Uro­czystego aktu konsekracji świątyni dokonał biskup płocki Andrzej Krzycki (po roku 1531). Obecny swój wygląd katedra zawdzięcza regotyzacji dokonanej po II wojnie światowej.