Jednocześnie 6-węglowy łańcuch zostaje skrócony do 5-węglowego.

Faza nieoksydacyjna Podczas tej fazy rybulozo-5-fosforan zostaje przekształcony w rybozo-5-fosforan lub ulega wieloetapowym przekształceniom w metabolity glikolizy.

thumb|center|600px|Faza nieoksydacyjna szlaku pentozofosforanowego

+ Reakcje fazy nieoksydacyjnej Substraty Produkty Enzym Opis rybulozo-5-fosforan → rybozo-5-fosforan izomeraza pentozofosforanowa izomeryzacja rybulozo-5-fosforan → ksylulozo-5-fosforan epimeraza pentozofosforanowa epimeryzacja ksylulozo-5-fosforan + rybozo-5-fosforan → aldehyd 3-fosfoglicerynowy + sedoheptulozo-7-fosforan transketolaza sedoheptulozo-7-fosforan + aldehyd 3-fosfoglicerynowy → erytrozo-4-fosforan + fruktozo-6-fosforan transaldolaza ksylulozo-5-fosforan + erytrozo-4-fosforan → aldehyd 3-fosfoglicerynowy + fruktozo-6-fosforan transketolaza Reakcje tego etapu są odwracalne.