Po reformie administracyjnej Kościoła katolickiego w Polsce, jakiej dokonał papież Jan Paweł II w bulli apostolskiej Totus Tuus Poloniae Populus z 25 marca 1992, został włączony do duchowieństwa diecezji elbląskiej. Pierwszy biskup elbląski ks. dr Andrzej Śliwiński (1992–2003) powierzył mu obowiązki delegata biskupa elbląskiego ds. kleryków diecezji elbląskiej studiujących w Wyższym Seminarium Duchownym „Hosianum” w Olsztynie (1992–1993), a następnie organizatora i pierwszego rektora Wyższego Seminarium Duchownego w Elblągu (1993–2004). Ponadto w Wyższym Seminarium Duchownym w Elblągu sprawował funkcję wykładowcy teorii poznania, filozofii Boga, filozofii religii i wstępu do filozofii.
Jest członkiem Kolegium Konsultorów Diecezji Elbląskiej (od 1992), członkiem Rady ds. Ekonomicznych Kurii Diecezjalnej w Elblągu, członkiem i sekretarzem Rady Kapłańskiej I i II kadencji (od 1997), przewodniczącym Komisji Wzajemnej Pomocy Kapłańskiej (od 1996), sędzią Sądu Diecezjalnego i członkiem redakcji „Studiów Elbląskich” (od 1999).