Najlepsze zespoły obu trzecich dywizji, w tym Accrington Stanley, przydzielono do jednej, ogólnokrajowej Third Division, zaś drugą połowę klubów przesunięto do ogólnokrajowej czwartej dywizji (Fourth Division). Już po dwóch latach znalazł się w niej zespół z Accrington, który ukończył sezon 1959/1960 na ostatnim miejscu w trzeciej dywizji, a spory udział miały w tym rosnące problemy finansowe klubu. Zimą 1962 roku, w połowie drugiego sezonu występów Accrington Stanley w Fourth Division, wyszło na światło dzienne zadłużenie klubu, sięgające dziesiątek tysięcy funtów. Pilkington poddał się i wysłał do zarządu rozgrywek list z rezygnacją z występów w The Football League, co ostatecznie nastąpiło 11 marca 1962 roku.
Zespół ponownie przystąpił do lokalnych rozgrywek Lancashire Combination. W swoim drugim sezonie występów, klub nieoczekiwanie zdobył mistrzostwo drugiej dywizji tych rozgrywek. Nie osiągnął tego jednak jako Accrington Stanley F.C., lecz jako Accrington F.C., bowiem w 1963 roku, zadłużenie zmusiło klub do usunięcia chlubnej cząstki "Stanley" ze swojej nazwy. Po uzyskaniu awansu do pierwszej dywizji Lancashire Combination, klub podążył już prostą drogą ku ostatecznemu upadkowi.