Aleksander Mohuczy zastąpił na tym stanowisku komandora Pławskiego, który objął stanowisko szefa Broni Podwodnej Kierownictwa Marynarki Wojennej w WarszawieKacper Śledziński: Odwaga straceńców, s. 37-38.. Dowódcy okrętów podlegali bezpośrednio dowódcy dywizjonu. Strukturę dowodzenia dywizjonem według stanu z początku 1939 roku przedstawia schemat.
Dowódcy Dywizjonu Okrętów Podwodnych kmdr ppor. Eugeniusz Pławski 1 maja 1932 6 lipca 1936 kmdr ppor. Aleksander Mohuczy 6 lipca 1936 2 października 1939
+ Dowódcy okrętów i ich zastępcy 31 sierpnia 1939 roku. Typ Okręty Numer burtowy Wejście do służby Dowódca Zastępca dowódcyWilk „Wilk” W 31 października 1931 kpt. mar. Bogusław Krawczyk kpt. mar. Borys Karnicki „Ryś” R 2 sierpnia 1931 kmdr ppor. Aleksander Grochowski kpt. mar. Jerzy Rekner „Żbik” Ż 20 lutego 1932 kmdr ppor. Michał Żebrowski kpt. mar. Wilhelm KamudaOrzeł „Orzeł” 2 lutego 1939 kmdr ppor. Henryk Kłoczkowski kpt. mar. Jan Grudziński „Sęp” 16 kwietnia 1939 kmdr ppor. Władysław Salamon kpt. mar. Justyn Karpiński