Prowadził własny warsztat (do kwietnia 1811), w którym kształcił uczniów, w tym własnych synów oraz Karola Wolframa Polsnera, profesora rysunku z Wrocławia, który potrzebował toruńskiego dyplomu czeladniczego, by móc podjąć pracę w Toruniu.
thumb|240px|Pałac Kruszyńskich w Nawrze Z prac rzemieślniczych malarskich, wykonywanych przez Jana Bogumiła Jacobiego, wymienić można prace w kościołach Chełmna (1781) oraz „roboty olejne” w pałacu Kruszyńskich w Nawrze koło Torunia (1804). Dla rodziny Kruszyńskich Jacobi wykonał ponadto pięć portretów na potrzeby epitafium w kościele w Nawrze (1815); były to wizerunki Bernarda, Jana, Waleriana, Antoniego i Ludwiki (z Kochanowskich) Kruszyńskich, z czego portrety Waleriana i Antoniego Kruszyńskich Jacobi skopiował z oryginałów znajdujących się w pałacu w Nawrze, natomiast pozostałe prawdopodobnie były całkowicie jego własnym dziełem. Portrety rodzinne Kruszyńskich mają pozornie charakter sarmacki, jednak dążenie twórcy do idealizacji modeli wskazuje na wpływy neoklasycystyczne.