Po wkroczeniu na Litwę wojsk sowieckich w 1940 działalność tautininków została zakazanaPartia uległa likwidacji na mocy decyzji ministra spraw wewnętrznych Republiki Litewskiej, który powołał się na art. 48 ustawy o stowarzyszeniach, zob.: Zamknięty Związek Narodowców, "Dzień Polski", nr 136, 21 czerwca 1940, s. 3, a ich działacze zostali poddani represjom.
Ugrupowanie w niepodległej Litwie Związek Litewskich Narodowców został założony na nowo po odzyskaniu przez Litwę niepodległości w 1990, jednak nie odzyskał dawnej pozycji ani na ogólnolitewskiej scenie partyjnej, ani wśród partii prawicowych. W wyborach sejmowych z 1992 partia wywalczyła 4 mandaty, cztery lata później – 3, posłem został wówczas m.in. jej lider Rimantas Smetona. Większe sukcesy partia odnosiła w wyborach samorządowych – w 1995 zdobyła 49 miejsc, w 1997 – 23, w 2000 – 13, w 2002 – 14, w wyborach z 2007 – 3. Przez długi czas merem rejonu okmiańskiego był członek LTS Anicetas Lupeika.
Kolejnymi przewodniczącymi ugrupowania po odzyskaniu przez Litwę niepodległości byli m.in.