ze stanowiska tego został odwołany 13 maja 1980 (zastąpił go płk Franciszek Szystowski). 27 maja 1978 został mianowany członkiem Wojskowej Komisji Orzekającej. 15 maja 1980 roku Prezydent RP na Uchodźstwie, Edward Raczyński mianował go Ministrem Spraw Wojskowych w gabinecie Kazimierza Sabbata. W 1983 roku Prezydent RP na Uchodźstwie mianował go generałem brygady. 17 grudnia 1983 roku Prezydent RP na Uchodźstwie zwolnił go z urzędu Ministra Spraw Wojskowych i powierzył mu pełnienie obowiązków do czasu powołania nowego rządu, co nastąpiło w dniu 17 stycznia 1984 roku. Do śmierci był Kanclerzem Kapituły Orderu Odrodzenia Polski na uchodźstwie. mały|Grób Jana Berka Zmarł 18 czerwca 1986 roku w LondynieWedług innego źródła zmarł 20 czerwca 1986, zob. . Został pochowany na cmentarzu Gunnersbury.
Ordery i odznaczenia Krzyż Złoty Orderu Wojennego Virtuti Militari nr 153 (1939) Krzyż Srebrny Orderu Wojskowego Virtuti Militari nr 149 (17 maja 1921)Dekret Wodza Naczelnego L. 2980 z 17 maja 1921 r. Dziennik Personalny z 1921 r. Nr 21, poz. 820 Krzyż Komandorski Orderu Odrodzenia Polski (11 listopada 1974) Krzyż Kawalerski Orderu Odrodzenia Polski Krzyż Walecznych (czterokrotnie) Złoty Krzyż Zasługi z Mieczami Złoty Krzyż Zasługi (10 listopada 1928)M.P. z 1928 r. nr 260, poz.