Jego dyrektorem jest Aleš Rumpel, czeski działacz na rzecz LGBT. W kręgu zainteresowania festiwalu jest szeroko pojęte kino zajmujące się mniejszościami seksualnymi. Dużą część z pokazywanych filmów stanowią produkcje z krajów Europy Wschodniej. Główne seanse odbywają się w praskim kinie „Svetozor”. Festiwal Mezipatra współpracuje blisko z krakowskim festiwalem kultury gejowskiej i lesbijskiej Kultura dla Tolerancji.
Historia mały|lewo|Mezipatra 2009 i plakaty autorstwa Jana Kolářa|280px Festiwal wyrósł z przeglądu filmowego o nazwie „Duha nad Brnem” (Tęcza nad Brnem) zorganizowango po raz pierwszy 19-22 czerwca 2000 r. w salach kina „Art”. Pokazano wówczas 7 filmów fabularnych i dokument w reżyserii Štefana Vraštiaka, trzy spektakle muzyczne Teatru Narodowego w Brnie oraz trzy wystawy fotografii autorów ze środowiska gejowskiego. Odnotowano wówczas frekwencję w liczbie 800 widzów. Ponadto w ramach przeglądu, 24 czerwca odbyła się gala konkursu na najsympatyczniejszego geja „Gay Man ČR 2000” zorganizowana w Laser Show Hall brneńskiego Boby Center, w której wzięło udział kilka tysięcy osób.