W 1960 roku spotkała się grupa osób, które postanowiły odbudować zniszczone więzienie.
Muzeum W kwietniu 1966 roku muzeum mieszczące się we wschodnim skrzydle, zostało otwarte przez prezydenta Éamona de Valera. Był on jednym z ostatnich więźniów wypuszczonych w 1924 roku. W latach 1960–1986 budynkiem i muzeum zarządzała Kilmainham Jail Restoration Society (KJRS). Zbierała ona przedmioty związane z historią Irlandii od 1798 roku. Prezentowano je we wschodnim skrzydle budynku więzienia. Muzeum otrzymało wtedy jako darowizny materiały dotyczące Charlesa Stewarta Parnella i Michaela Collinsa, przedmioty i dokumenty należące do straconych przywódców powstania z 1916 roku oraz duży zbiór broni wykorzystywany głównie w latach 1914–1923. W 1986 roku kolekcja została przekazana pod zarząd państwa. Nadzór objął Urząd Robót Publicznych (Office of Public Works), który zaczął zbierać materiały dotyczące historii więzienia Kilmainham Gaol, równocześnie kontynuując gromadzenie materiałów dotyczących historii Irlandii. Muzeum w Kilmainham Gaol otwarto w 1996 roku.