W siódmym sezonie, przez pewien czas spotykał się ponownie ze swoją pierwszą żoną – Sam, jednak zakończyło się to rozstaniem. Kiedy dowiedział się o związku House’a i Cuddy z początku był nastawiony sceptycznie, jednak potem kibicował ich relacji.
Życie prywatne Jest znany z bogatego życia uczuciowego, umawiania się na randki z pracownicami szpitala, a nawet zbytniego przywiązywania się emocjonalnie do swoich śmiertelnie chorych pacjentek – zamieszkał i sypiał z jedną z nich.
Ma za sobą trzy nieudane małżeństwa oraz problemy z utrzymaniem wierności byłym żonom. Jego pierwszą żoną była Samantha Carr – byli małżeństwem (według różnych źródeł) od 1990 do 1991 roku. Na pewno oboje nie znali wtedy House’a. Sam jest radiologiem, lecz nie wiadomo gdzie pracuje. Drugą żoną Wilsona była Bonnie, z którą poznał się na krótko po rozstaniu z Sam. Nie wiadomo dokładnie jak długo byli małżeństwem, lecz rozstali się krótko przed pierwszym sezonem (powodem była zdrada Jamesa). Mieli psa Hectora.