Struktura administracyjna Jurysdykcja patriarchatu aleksandryjskiego obejmuje całą Afrykę. Należy do niego wiernych. Kościół prowadzi szeroko zakrojoną działalność misjonarską i charytatywną. W ramach patriarchatu działają następujące administratury: Metropolia Aleksandrii (Egipt) Metropolia Memfis (Egipt) Metropolia Leontopolis – Ismailia (Egipt) Metropolia Cyreny (Egipt) Metropolia Heliopolis (Egipt) Metropolia Peluzjum – Port Said (Egipt) Metropolia Ptolemaidy (Egipt) Metropolia Hermopolis – Tanta (Egipt; język liturgiczny – arabski) Metropolia Aksum (Etiopia, Erytrea, Dżibuti, Somalia) Metropolia Nairobi (część Kenii)PRESS RELEASE FROM THE FIRST DAY OF DELIBERATIONS OF THE HOLY SYNOD OF THE PATRIARCHATE OF ALEXANDRIA [dostęp 2015-11-24] Metropolia Kampali (część Ugandy) Metropolia Nigerii (Nigeria, Benin, Niger, Togo) Metropolia Trypolisu (Libia) Metropolia Johannesburga i Pretorii (część RPA) Metropolia Przylądka Dobrej Nadziei (część RPA, Namibia, Eswatini, Lesotho) Metropolia Kartaginy (Tunezja, Algieria, Maroko, MauretaniaSerwis Polskiego Autokefalicznego Kościoła Prawosławnego – Pierwszy duchowny w Mauretanii [dostęp 2010-07-27]) Metropolia Nubii (Sudan, Sudan Południowy) Metropolia Zimbabwe i Angoli Metropolia Mwanzy (część Tanzanii) Metropolia Irinoupolis (część Tanzanii i Seszele) Metropolia