W 1998 roku Wydział, jako pierwszy w kraju, zmienił nazwę na Wydział Nauki o Żywności, a w roku 1999 wszedł w struktury nowo utworzonego Uniwersytetu Warmińsko-Mazurskiego. W tym samym roku dokonało się kolejne poszerzenie oferty kształcenia Wydziału o trzeci kierunek: Inżynieria chemiczna i procesowa. Z kolei w 2011 r. wspólnie z Wydziałami Bioinżynierii Zwierząt oraz Kształtowania Środowiska i Rolnictwa uruchomiono makrokierunek Gastronomia - sztuka kulinarna.
W latach 1978–1981 dziekanem Wydziału Technologii Żywności ART w Olsztynie był prof. Jan Kisza.
Kierunki kształcenia Dostępne kierunki: Bezpieczeństwo i certyfikacja żywności (studia I stopnia) Gastronomia - sztuka kulinarna (studia I i II stopnia) Technologia żywności i żywienie człowieka (studia I i II stopnia)