Od roku 1999 w szkole zaszły ogromne zmiany. Został opracowany wewnątrzszkolny system oceniania, dokonano nowelizacji statutu szkoły, dostosowując go do wymogów zreformowanego systemu oświaty w Polsce. We wrześniu 2003 roku szkoła przystąpiła do akcji organizowanej przez „Gazetą Wyborczą” – „Szkoła z klasą”. Po spełnieniu określonych regulaminem wymagań szkoła otrzymała tytuł „Szkoły z klasą”.
W roku 2002 nastąpiło przekształcenie na mocy uchwały Rady Miasta Częstochowy numer 734/LVIII/02 z dnia 31/01/02 szkoły ponadpodstawowej V Liceum Ogólnokształcącego im. A. Mickiewicza w Częstochowie przy ul. Krakowskiej 29 w szkołę ponadgimnazjalną: „V Liceum Ogólnokształcące im. A. Mickiewicza w Częstochowie” ul. Krakowska 29.
Zmiana ta wynikała z przepisów wprowadzających reformą ustroju szkolnego z 1999 roku. Jako szczególny dzień zapisał się w kronikach szkoły 25 września 2004 roku. W tym dniu szkoła obchodziła swoje wielkie święto – 55 rocznicą istnienia. Obchody stały się okazją do odwiedzin dla przyjaciół, absolwentów, grona pedagogicznego. W części oficjalnej wprowadzono sztandar i odsłonięto tablicę pamiątkową. Część artystyczną poświęcono przybliżeniu sylwetki Adama Mickiewicza i jego twórczości. Na korytarzach szkolnych można było zwiedzać wystawy m.in.