W 2000 roku klub zmienił nazwę na Spartak Sumy. W sezonie 2000/01 zajął spadkowe 17 miejsce w Pierwszej Lidze i spadł do Drugiej Lihi. W następnym sezonie udało się zdobyć awans do Pierwszej Lihi. Klub zmienił nazwę na FK Sumy i w celu wzmocnienia latem 2002 połączył się z innym sumskim klubem Frunzenec-Liha-99. W 2003 klub powrócił do starej nazwy Spartak Sumy. W latach 2004–2005 występował pod nazwą Spartak-Horobyna Sumy.
W sezonie 2006/07 klub przystąpił do rozgrywek w Drugiej Lidze, ale nie zagrał nawet połowy meczów, dlatego wyniki rozegranych meczów anulowano. Z powodu problemów finansowych klub został rozformowany. 28 listopada 2006 roku klub został dyskwalifikowany z rozgrywek Drugiej Lihi.
Sukcesy 9 miejsce w Pierwszej Lidze: 1999/00, 2003/04 1/4 finału Pucharu Ukrainy: 2000/2001
Piłkarze
Trenerzy od lat 90.