Tour de Ski 2008/2009 to trzecia edycja tej prestiżowej imprezy w biegach narciarskich, która odbywa się na przełomie roku. Tytułu wywalczonego rok wcześniej bronił wśród mężczyzn Czech Lukáš Bauer. W rywalizacji kobiet do startu nie przystąpiła z przyczyn zdrowotnych zwyciężczyni Tour de Ski 2007/2008 Szwedka Charlotte Kalla.
Ponownie nastąpiły zmiany w kalendarz Touru. Tym razem Tour rozpoczął się w Niemczech, a nie jak dotychczas planowano w CzechachPodczas pierwszej edycji 2006/2007 planowano zawody w Novym Měscie jednak z powodu braku śniegu odwołano zawody. Jest to zarazem najkrótszy dotychczas zaplanowany turniej ze wszystkich dotychczasowych (poprzednie 8 konkursów, tutaj 7).
Klasyfikacja generalna Kobiety Miejsce Imię i nazwisko Narodowość OberhofMsc./Pkt OberhofMsc./Pkt PragaMsc./Pkt Nové MěstoMsc./Pkt Nové MěstoMsc./Pkt Val di FiemmeMsc./Pkt Val di FiemmeMsc./Pkt Tour-Punkty PŚ-punktyrazem 1 Virpi Kuitunen 7 / 32 1 / 50 17 / 14 1 / 50 8 / 30 1 / 50 21 / 10 400 636 2 Aino-Kaisa Saarinen 8 / 30 5 / 37 2 / 46 2 / 46 3 / 43 3 / 43 15 / 16 320 581 3 Petra Majdič 3 / 43 6 / 34 3 / 43 5 / 37 2 / 46 2 / 25 16 / 15 240 504 4 Justyna Kowalczyk 3 / 43 3 / 43 11 / 24 4 / 40 26 / 5 15 / 16 4 / 40 200 411 5 Marianna Longa 17 / 14 8 / 30 12 / 22 6 / 34 6 / 34 4 / 40 9 / 28 180 382 6 Therese Johaug 26 / 5 14 / 18 32 / 0 7 /