Działania towarzystwa Praktyczna ochrona ochrona nietoperzy (kilka przedsięwzięć związanych z ochroną zimowisk, kolonii rozrodczych i żerowisk tych ssaków), program SUSEŁ (przywracanie faunie Polski wymarłego gatunku ssaka – susła moręgowanego), ochrona ptaków w miastach (zapobieganie skutkom niewłaściwego ocieplania bloków, ochrona sokołów pustułek itp.), ochrona walorów przyrodniczych Doliny Noteci (program prowadzony przez Koło Nadnoteckie „Salamandry”), ochrona popielicy w Polsce Zachodniej (przywracanie tego nadrzewnego ssaka w miejsca, w których niegdyś wyginął, a odpowiednie dla niego siedliska znów istnieją), reintrodukcja mieczyka błotnego w Wielkopolsce (przywracanie tej niemal wymarłej w Polsce rośliny na łąkach w dolinie Noteci – program połączony z ochroną ekstensywnie użytkowanych łąk oraz ochroną trzmieli).
Działania prawne i lobbingowe Natura 2000 (starania o właściwe wyznaczenie sieci Natura 2000 w Polsce, tworzenie kolejnych wersji tzw. Shadow List, tworzenie planów ochrony obszarów i kontrola ich skutecznej ochrony), program Ginące Gatunki (ograniczanie zagrożeń wynikających z nielegalnego handlu zagrożonymi gatunkami), zapobieganie szkodom przyrodniczym ich likwidacja (wprowadzanie w życie tzw.