Do 1978 była dodatkowo członkiem Zarządu Głównego PTL, a latach 1967-1970 wiceprezesem.
Pracę w muzeum łączyła z wyjazdami na konferencje krajowe, zagraniczne i uczestnictwem w prestiżowych gremiach takich m.in. jak Zespół Doradczy przy Zarządzie Muzeów i Ochrony Zabytków, Sekcja Muzeów i Ochrony Dóbr Kultury przy Ministerstwie Kultury i Sztuki.
W 1978 roku za zasługi dla działalności PTL zostało nadane jej członkostwo honorowe PTL.
Ordery i odznaczenia Krzyż Komandorski Orderu Odrodzenia Polski (1978) Krzyż Oficerski Orderu Odrodzenia Polski Złoty Krzyż Zasługi (10 marca 1939) „za zasługi na polu pracy zawodowej”. Medal Komisji Edukacji Narodowej (1984) Odznaka tytułu honorowego „Zasłużony dla Kultury Narodowej” (1988) Nagroda im. Oskara Kolberga (1976)
Upamiętnienie Od 15 grudnia 1999 roku Muzeum Etnograficzne w Toruniu nosi jej imię. Uroczysty akt nadania imienia miał miejsce z okazji 40-lecia działalności instytucji. Uroczystość uwieńczono wmurowaniem pamiątkowej tablicy. Jedną z ulic lewobrzeżnego Torunia nazwano imieniem Marii i Jana Prüfferów.