Publikacje W roku 2011, z okazji 60. rocznicy urodzin ks. prof. W. Chrostowskiego, Stowarzyszenie Biblistów Polskich wydało poświęconą mu trzytomową księgę pamiątkową. Pierwszy tom stanowi wykaz publikacji. Pierwsza jego publikacja ukazała się w 1966 roku (Satura lanx, Filomata 1966 nr 198, s. 431). Do czerwca 2011 liczba publikacji wyniosła 2054. Nie uwzględniono publikacji multimedialnychWięcej szczęścia w dawaniu niż w braniu. Księga Pamiątkowa dla Księdza Profesora Waldemara Chrostowskiego. pod red. Barbary Strzałkowskiej, Stowarzyszenie Biblistów Polskich, Warszawa 2011, s. 217, 218..
Wybrane pozycje własne Bohaterowie wiary Starego Testamentu, Akademia Teologii Katolickiej, Warszawa 1992, . Rozmowy o dialogu, Vocatio, Warszawa 1996, . I będę mówił do jej serca – księga proroka Ozeasza, producent: Wydawnictwo Salwator, 2007 – audiobook, analiza Księgi Ozeasza. Bóg, Biblia, Mesjasz, Fronda, Warszawa 2009, . Kościół, Żydzi, Polska, Fronda, Warszawa 2012, . Babilońskie deportacje mieszkańców Jerozolimy i Judy oraz inne studia, Rozprawy i Studia Biblijne 34, Vocatio, Warszawa 2009. Trzecia Świątynia w Jerozolimie i inne studia, Rozprawy i Studia Biblijne 44, Vocatio, Warszawa 2012, . Między Synagogą a Kościołem. Dzieje św. Pawła, Wydawnictwo M, Kraków 2015, . Dziedzictwo Chrztu. 966 – 1966 – 2016, współ.