Latem 2003 awansował z Celtą do fazy grupowej Ligi Mistrzów, jednak zespół z Vigo w lidze był przedostatni i spadł do Segunda División.
W lipcu 2004 roku Edú został sprzedany za 5,5 miliona euro do innego klubu Primera División, Realu Betis z Sewilli. W nowym zespole swój pierwszy mecz rozegrał 12 września, a Betis przegrał w nim 1:4 z Espanyolem (zdobył jedynego gola dla Betisu w tym spotkaniu). W całym sezonie 2004/2005 zaliczył 11 trafień i był najlepszym strzelcem zespołu obok rodaka i partnera z ataku Ricardo Oliveiry. W La Liga Betis był czwarty, a Edú w sezonie 2005/2006 wystąpił w fazie grupowej Ligi Mistrzów oraz w Pucharze UEFA. W lidze zdobył tylko 3 gole, a rok później – 8 i dwukrotnie pomógł Realowi w utrzymaniu w lidze. W sezonie 2007/2008 znów zdobył najwięcej bramek w drużynie – 12, o cztery więcej niż partner z ataku Argentyńczyk Mariano Pavone.
W 2009 Edú wrócił do Brazylii, gdzie podpisał kontrakt z klubem SC Internacional z miasta Porto Alegre. Z Internacionalem wygrał rozgrywki Copa Libertadores 2011. Od czerwca do września 2011 Edú był zawodnikiem drugoligowej Vitórii Salvador.