Co roku trasa maratonu ma inny przebieg – główną areną zmagań jest Beskid Wyspowy, ale często trasa prowadzi również przez inne, sąsiednie pasma. Uczestnicy tuż przed rozpoczęciem imprezy otrzymują mapę z lokalizacją i numeracją punktów kontrolnych, których kolejność zaliczania jest obowiązkowa. Start odbywa się w piątek o godz. 18., niezależnie od warunków pogodowych. Uczestnicy maszerują przez kolejne punkty kontrolne z limitem czasowym 30 godzin, który w wyjątkowych sytuacjach może zostać wydłużony z uwagi na niekorzystne warunki pogodowe (np. burze).
Za udział w maratonie nagrodą jest satysfakcja z przejścia założonego dystansu oraz z pokonania własnych słabości, zmęczenia i czasem niesprzyjającej pogody. Każdy uczestnik, który zaliczy przynajmniej jeden punkt kontrolny otrzymuje pamiątkowy dyplom i medal. Pomysłodawca i sędzia główny maratonu zawsze podkreśla, że Kierat to nie są zawody sportowe, ale impreza turystyki kwalifikowanej, w której zwycięzcą jest każdy, kto wygrał walkę z własnymi słabościami. Zajęta lokata w klasyfikacji ma drugorzędne znaczenie.