Jednak Mazepa, który nie lubił Apostoła, nie wysłał go z wieściami o udanej wyprawie do Moskwy, wiedząc, że posłańcy będą szczodrze obdarowani.
Już w 1697 roku Mazepa, który udał się bronić zdobytych wcześniej tatarskich umocnień, wybrał Apostoła hetmanem nakaźnym.
W 1700 roku udał się na granicę ze Szwecją.
III Wojna Północna W czasie III wojny północnej Rosji (w latach 1700-1721) odznaczył się w walkach w Liwonii (dziś na północ od Rygi na Łotwie), pod rozkazami Borisa Szeremietiewa.
W 1704 wysłany na czele kozackiego oddziału 3000 ludzi na pomoc królowi polskiemu, gdzie brał udział w bitwie pod Warszawą w 1705 roku.
Danyło Apostoł był stronnikiem niezależnej polityki Iwana Mazepy i jednym z negocjatorów zawiązania kozacko-szwedzkiego sojuszu. 25 października 1708 wraz z kozackimi pułkami przyłączył się do armii szwedzkiej. Ale już w listopadzie, przeanalizowawszy porażki szwedzkie na terenie Ukrainy, zmienił front i przeszedł na stronę Piotra Wielkiego. Brał udział w bitwie pod Połtawą po stronie rosyjskiej.