Mimo wprowadzenia w tej wersji Windows mechanizmów OLE i przechowywania informacji o nich w rejestrze nie było możliwe ich konfigurowanie za pomocą edytora.
W systemach Windows NT 3.x pojawiła się 32-bitowa aplikacja Regedt32.exe będąca pierwowzorem dzisiejszego edytora rejestru. Przedstawiała ona strukturę rejestru w sposób przypominający wyświetlanie plików przez Eksploratora Windows. W lewej części okna znajduje się drzewo przedstawiające strukturę kluczy rejestru. Prawa część zawiera listę wartości znajdujących się w zaznaczonym kluczu rejestru. Regedt32 umożliwiał też edycję wprowadzonych w NT uprawnień dostępu do kluczy rejestru. Regedt32 nie pozwalał natomiast na importowanie i eksportowanie rejestru do plików .reg. W systemach NT była także dostępna aplikacja regedit.exe. Była ona przeniesiona z domowych wersji okienek w celu zachowania kompatybilności z 16-bitowymi aplikacjami Windows.
Wraz z systemem Windows 95 Regedit uzyskał interfejs przeniesiony z regedt32. Dodano także obsługę menu kontekstowych. Ta koncepcja interfejsu jest używana do chwili obecnej. Także aplikacja Regedit na platformach NT od wersji 4.0 uzyskała nowy wygląd, jednak nie posiadała zaawansowanych możliwości regedt32 (Regedit został przeniesiony z Windows 95 bez żadnych modyfikacji).