W 1985 roku Pardeza nie mając miejsca w pierwszym składzie "Królewskich" został na rok wypożyczony do Realu Saragossa. Tam swój pierwszy mecz rozegrał 1 września przeciwko Hércules CF (1:0). Dla Saragossy strzelił 5 goli i zajął 4. miejsce w lidze, co spowodowało, że po sezonie wrócił na Estadio Santiago Bernabéu. Tam także zdobył 5 bramek i wywalczył mistrzostwo Hiszpanii. W 1987 roku znów odszedł do Realu Saragossa, tym razem na zasadzie transferu definitywnego. W Saragossie miał pewne miejsce w pierwszym składzie, a w sezonie 1993/1994 zajął 3. miejsce w Primera División i przyczynił się do wywalczenia pierwszego w karierze Pucharu Hiszpanii (rok wcześniej Real dotarł do finału i przegrał 0:2 z Realem Madryt). W sezonie 1994/1995 Pardeza z partnerami wystartował w Pucharze Zdobywców Pucharów. Dotarł do finału, a tam zespół z Aragonii pokonał 2:1 po dogrywce angielski Arsenal F.C. i zdobył swoje drugie w historii europejskie trofeum. W Saragossie, Miguel występował do końca sezonu 1996/1997.