Długość linii brzegowej wynosi 5025 m.
Według Mapy Podziału Hydrograficznego Polski jezioro leży na terenie zlewni szóstego poziomu Zlewnia jez. Wilkowskiego. Identyfikator MPHP to 158323.
Zagospodarowanie W systemie gospodarki wodnej jezioro tworzy jednolitą część wód o kodzie PLLW10039. Administratorem wód jeziora jest Regionalny Zarząd Gospodarki Wodnej we Wrocławiu. Utworzył on obwód rybacki, który obejmuje między innymi wody jeziora Wilkowskiego oraz rzeki Borowianka (Obwód rybacki jeziora Wilkowskie na rzece Borowianka nr 1). Gospodarkę rybacką na jeziorze prowadzi państwowe Gospodarstwo Rybackie w Zbąszyniu.
Jezioro pełni również funkcje rekreacyjne, od 2018 roku na jeziorze funkcjonuje kąpielisko wyznaczone z zasadami dyrektywy kąpieliskowej – Kąpielisko Miejskie nad jeziorem Wilkowskim. W 2022 roku jego jakość wód oceniono jako doskonałą.
Czystość wód i ochrona środowiska Podczas badań w latach 1993, 1999, 2004 stan wód jeziora sklasyfikowano według ówczesnych kryteriów w II klasie czystości. W 1993 roku jako jedno z zagrożeń dla jeziora wymieniono nieoczyszczone ścieki ze zlokalizowanej w Wilkowie gorzelni.