24 lipca 2001 Symeon Sakskoburggotski objął urząd premiera, stając na czele gabinetu współtworzonego również przez Ruch na rzecz Praw i Wolności.
Gabinet przetrwał całą czteroletnią kadencję, jednakże premier tracił popularność. W wyborach z czerwca 2005 Narodowy Ruch Symeona Drugiego otrzymał 19,9% głosów, co przyniosło 53 mandaty poselskie. Partia weszła w koalicję ze zwycięską Bułgarską Partią Socjalistyczną oraz Ruchem na rzecz Praw i Wolności. W sierpniu tegoż roku były car zakończył pełnienie funkcji premiera, nie objął żadnej funkcji w rządzie Sergeja Staniszewa. W wyborach z lipca 2009 jego formacja nie przekroczyła wyborczego progu. Wkrótce po tej porażce Symeon Sakskoburggotski odszedł ze stanowiska jej przewodniczącego.
W 2014 opublikował autobiografię.
Odznaczenia i wyróżnienia Wielki Mistrz Orderu Świętych Cyryla i Metodego (Bułgaria) Wielki Mistrz Orderu Świętego Aleksandra (Bułgaria) Wielki Mistrz Orderu Czerwonego Krzyża (Bułgaria) Order Zasługi Cywilnej (Bułgaria) – b. Wielki Mistrz Order Zasługi Wojskowej (Bułgaria) – b. Wielki Mistrz Order Waleczności (Bułgaria) – b.