Dyplomacja szwedzka wobec kryzysu monarchii we Francji w latach 1787–1792, obronił 15 lutego 2001 r., recenzenci: Jerzy Grobis, Jacek Staszewski i Władysław Zajewski. Uzyskał stopień naukowy doktora habilitowanego nauk humanistycznych w zakresie historii powszechnej nowożytnej. 1 lipca 2003 r. został zatrudniony na stanowisku profesora nadzwyczajnego w dotychczasowym Zakładzie. 22 października 2007 r. Prezydent Rzeczpospolitej Polskiej nadał Zbigniewowi Anusikowi tytuł naukowy profesora nauk humanistycznychMusimy walczyć o pozycję polskiej nauki Prezydent.pl [dostęp 2026-02-17].Postanowienie Prezydenta Rzeczypospolitej Polskiej z dnia 22 października 2007 r. nr 115-7-07 o nadaniu tytułu profesora ()..
Pełnił też funkcje administracyjne, dydaktyczne i organizacyjne na Wydziale Filozoficzno-Historycznym UŁ. W latach 1999–2002 był pełnomocnikiem dyrektora Instytutu Historii do Spraw Dydaktycznych. Od 1 września 2002 do 31 sierpnia 2008 r. sprawował funkcję prodziekana Wydziału Filozoficzno-Historycznego ds. Nauczania. Pracę tę łączył z obowiązkami dyrektora Instytutu Historii (od 1 listopada 2005 do 30 września 2008 r.). 1 października 2005 r. objął kierownictwo samodzielnego Zakładu Historii Nowożytnej Krajów Nadbałtyckich, a od 1 czerwca 2006 r. stanął na czele Katedry Historii Nowożytnej Polski i Krajów Nadbałtyckich.