Tam spędził jeden sezon, a już na początku 2008 roku przeszedł do lokalnego rywala Tokyo Verdy 1969.
Sezon Klub Kraj Rozgrywki Mecze Bramki 1995 Júbilo Iwata
J-League 10 1 1996 Júbilo Iwata
J-League 28 3 1997 Júbilo Iwata
J-League 30 6 1998 Júbilo Iwata
J-League 30 3 1999 Júbilo Iwata
J-League 30 11 2000 Júbilo Iwata
J-League 34 5 2001 Júbilo Iwata
J-League 29 5 2002 Júbilo Iwata
J-League 32 5 2003 Júbilo Iwata
J-League 26 5 2004 Júbilo Iwata
J-League 26 6 2005 Júbilo Iwata
J-League 23 2 2006 Júbilo Iwata
J-League 26 7 2007 FC Tokyo
J-League 28 6 2008 Tokyo Verdy
J-League 29 3
Kariera reprezentacyjna W reprezentacji Japonii Fukunishi zadebiutował 29 czerwca 1999 roku w przegranym 2:3 spotkaniu Copa América 1999 z Peru. W 2002 roku został członkiem kadry na Mistrzostwa Świata 2002 i zagrał tam w wygranym 1:0 meczu z Rosją. W 2004 roku wywalczył Puchar Azji. W 2006 roku Zico powołał Fukunishiego na Mistrzostwa Świata w Niemczech.