Sezon Klub Kraj Rozgrywki Mecze Bramki 1996 Cerro Porteño Primera División 30 5 1997 Cerro Porteño Primera División 4 0 1998 Cerro Porteño Primera División 8 0 1999 Cerro Porteño Primera División 0 0 2000 Club Guaraní Primera División 11 0 2001 Club Guaraní Primera División 26 2 2002 Cerro Porteño Primera División 21 2 2003 Cerro Porteño Primera División 11 1 2003/04 Club Atlético Banfield Primera División 34 1 2004/05 Arsenal de Sarandí Primera División 34 2 2005/06 Racing Club de Avellaneda Primera División 8 0 2005/06 Estudiantes La Plata Primera División 11 0 2007 Cerro Porteño Primera División 35 3 2008 Cerro Porteño Primera División
Kariera reprezentacyjna W reprezentacji Paragwaju Núñez zadebiutował 2 kwietnia 2003 roku zremisowanym 1:1 towarzyskim spotkaniu z Hondurasem. Natomiast w 2006 roku został powołany przez Aníbala Ruiza do kadry na Mistrzostwa Świata w Niemczech, na których zaliczył wszystkie trzy grupowe spotkania – z Anglią (0:1), Szwecją (0:1) oraz Trynidadem i Tobago (2:0).