1909–1910 Matthias Friedwagner 1910–1911 Raimund Friedrich Kaindl 1912-1913 Hans von Frisch 1913–1914 Cäsar Pomeranz 1914–1918 Wasyl Tarnawski 1918–1920 Ion Nistor 1920–1921 Maximilian Hacman 1921–1922 Eugen Botezat 1922–1923 Valerian Sesan 1923–1925
Georghe Dregenescu 1926–1927 Nicolae Cotos 1927–1928 Valerian Sesan 1928–1930
Ion Nistor 1933–1940 Zachar Szulha 1940–1941
Pawło Kanibołocki 1944–1949 Kornij Leutśki 1949–1967 Kostiantyn Czerwinśki 1968–1987 Stepan Kostyszyn 1987–2001 Mykoła Tkacz 2001–2005 Stepan Melnyczuk 2005–2019 Roman Petryszyn od 2019
Nazwa Od powstania w 1875 roku do 1918 roku uczelnia nosiła nazwę Uniwersytetu im. Franciszka Józefa w Czerniowcach (niem. Franz-Josephs-Universität Czernowitz), w czasach rumuńskich (1918-40) nazwę zmieniono na Universitatea Regele Carol I din Cernăuți (rum. Królewski Uniwersytet Karola I w Czerniowcach), a po aneksji Bukowiny przez ZSRR na Czerniowiecki Uniwersytet Państwowy (ukr. Чернівецький Державний Університет), w 1989 roku patronem uczelni obrano Jurija Fedkowicza.