Znaczenie dla środowiska Kazuar mniejszy pomaga w roznoszeniu nasion wielu gatunków drzew poprzez zjadanie ich owoców. Pełni on też ważną rolę w rozsiewaniu diaspor mniejszych roślin. Pomimo faktu, że wiele z tych nasion jest toksycznych, ptaki z rodziny Casuariidae mogą je spożywać, ponieważ cechują się szybkim metabolizmem.
Znaczenie dla gospodarki Kazuary mniejsze są trzymane w niewoli jako zwierzęta hodowlane. Poluje się na nie również dla mięsa. Odnotowano ataki Casuarius bennetti na człowieka. Szczególnie w okresie rozmnażania samica staje się bardzo agresywna i potrafi zaatakować każdą istotę, jaką napotka na swojej drodze. Dlatego też powszechnie ten gatunek uważany jest za bardzo niebezpieczny.
Status zagrożenia Przez IUCN kazuar mniejszy od 2015 roku klasyfikowany jest jako gatunek najmniejszej troski (LC, Least Concern); wcześniej uznawany był za gatunek bliski zagrożenia (NT, Near Threatened). Liczebność populacji nie została oszacowana, ale ptak ten opisywany jest jako zazwyczaj rzadki, choć lokalnie pospolity w północno-wschodniej części Nowej Gwinei.