Trudno wyjaśnić przyczynę dziewiętnastowiecznej zamiany. Mogła ona wynikać z nieporozumienia, w związku z podobieństwem nazw obu miast, mogła mieć związek z podobieństwem tradycyjnego herbu Klecka do godła niepodległej Polski, co musiało być niemile widziane przez władze zaboru pruskiego. Oba czynniki mogły zadziałać jednocześnie, skłaniając ówczesne władze do zastosowania niewłaściwego herbu. Błąd zauważył w latach 30. XX wieku Marian Gumowski, pisząc, że miasto „ma swój własny i daleko starszy herb, którego powinno używać. Tym właśnie herbem m. Kłecka jest biały orzeł bez korony, na czerwonym tle.”.
W latach 1990 – 2024 Herbem Gminy i miasta była tarcza herbowa z mitrą książęcą i rogiem myśliwskim. Wzór herbu określiła Uchwała Rady Miasta i Gminy Kłecko z dnia 15 grudnia 1990 nr VI/61/90 w sprawie ustalenia herbu Gminy, powielając tym samym błąd powstały w drugiej połowie XIX wieku.
Od 1 marca 2024 roku Herbem Gminy i miasta Kłecka jest wizerunek niekoronowanego srebrnego (białego) orła o dziobie oraz szponach barwy złotej (żółtej), osadzonego w czerwonym polu tarczy późnogotyckiej.